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ラチェットの機転のおかげで、仲間に助けられてベースに戻るオプティマス。ジューンは子どもたちを過酷な戦いに巻き込むことはできないと、ラフを連れて出ていくが、車ごと竜巻に巻き込まれそうになり、バンブルビーに救出されてベースに戻ってくる。一連の異常気象は、惑星の配列により、ガイアユニクロンが目覚めようとしていることから起きていた。太古の昔、プライムの祖先たちがユニクロンを封印していた。オプティマスは、ユニクロンは地球に潜り込んだのではなく、地球の中核そのものがダークエネルゴンからできているのではないかと考える。一方、メガトロンは目覚めたガイアユニクロンと対面するが、ガイアユニクロンはメガトロンを認めない。オプティマスはガイアユニクロンと対峙し、地球そのものと、ガイアユニクロン自身が生み出した人類のために、再び眠りに戻るよう説得を試みるが、プライムに恨みをもつガイアユニクロンは聞く耳を持たず、戦いになってしまう。