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東京湾に浮上した巨大潜水空母。宿的・ジョウと決着を付けるべく、マリオはメグを人質に取り、ジョウをおびき寄せる。彼女らを作り出した組織ZEROの科学者たちは、最高性能をもったエンジェル同士の戦いの行方を見届けようとしていた。そんななか、ジョウは立ちはだかるガードサイボットたちを次々と撃ち倒し、メグのもとへと急ぐ! ジョウとマリオ、互いに人間兵器として育成された二人の死闘の行方は!?