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ガントローラーと呼ばれる超古代のオーパーツを復元しようとしていた和久井博士が誘拐された。和久井を探すグランセイザーたち。そんななかで愛は、父親がわりの援助をしてくれたいた、ドクターベアーに会いに行く。ドクターベアーとは和久井だった。和久井と愛は、ロギアに拉致されてしまう。そして救出に向かった天馬も捕まってしまうのだった。ロギアは超古代の巨大ロボット・ガントラスの操縦器・ガントローラーで、ガントラスを太陽に突入させ、太陽の異常燃焼によって人類を抹殺しようとしていた。