《神滅部隊》の襲撃後、行方不明となったみやびを探す巴と透流たちだが、島中捜しても見つからず途方に暮れる。そんな透流たちを他所に、臨海学校も終了し、みやびを見つけられないまま本校に戻る事になってしまう……。本校に戻ってきた透流たちはいつものように訓練に励むが、どこか上の空の透流と、やはりどこか無理をしている様子の巴。そんななか、朔夜は《IV(レベル4)》への《昇華の儀》を行う権利を与えると告げる。さらに、昊陵学園で《七芒夜会(レイン・カンファレンス)》が開催され、《装鋼の技師》も訪れると言われた透たちは……。