プレゼン番組の収録前日、顧南亭（グー・ナンティン）から使用する資料を見せられた程霄（チョン・シアオ）は、その難解な内容に思わず目を疑った。視聴者から共感を得るため柔軟な内容にすることを勧める程霄に対し、飛行の話題は厳密に伝えるべきだと譲ろうとしない南亭。互いの主張は平行線のまま解散することとなったが、程霄は宋宋（ソン・ソン）との雑談から解決のヒントを得る…。

来年度の女性パイロット募集決定を勝ち取り、打ち上げに繰り出した程霄（チョン・シアオ）と顧南亭（グー・ナンティン）。高級店だと聞いていた南亭は、屋台広場に連れてこられ驚くが、若手の頃に通った思い出の店に程霄はうれしそう。その後も始終、彼女に主導権を握られつつ、南亭も今日だけは特別に酒を飲み、２人だけの宴を楽しむのだった。お開きとなり、そろって帰宅すると、そこには…。

フライト前の顧南亭（グー・ナンティン）は妙な居心地の悪さを感じていた。廊下でひそひそと話す同僚たち、挨拶のあとに失望した表情を浮かべる祁玉（チー・ユー）、イヤホンをしてスマホで普段は見ていないトーク番組に爆笑する程霄（チョン・シアオ）。結局、その理由に気づくことなくフライトを終えた南亭だったが、リー・ユーハンがＳＮＳにアップした写真が原因だと知り…。

洪水被害に遭った蘭山（ランシャン）県へ災害支援に向かった鷺洲航空の一行。現地に到着すると、顧南亭（グー・ナンティン）のチームは、会社の支援で建設された小学校のある王家坪（ワンジアピン）へと車で進んでゆく。災害の影響もあり、道路の状況も悪く、途中の宿泊施設で１泊。その晩、南亭は、長年の付き合いである倪湛（ニー・ジャン）から、これまで内に秘めていた過去を明かされる…。

早朝、目を覚ました顧南亭（グー・ナンティン）の掌には、まだ程霄（チョン・シアオ）の手が握られていた。前日の子供の救出活動で程霄に命の危険が迫ってから、急速に心の距離を縮めた２人。同僚たちと雑魚寝する教室で大胆にもこっそりとつながれた手を、南亭は静かにほどくと、程霄の髪に触れようと運んだ手を止め、朝ごはんの支度へと出ていくのであった。そんな彼の様子を目撃していた人物が…。

機長候補となった程霄（チョン・シアオ）の左席デビューの当日。周りが祝福モードの中、肝心の程霄は浮かない表情だ。というのも、顧南亭（グー・ナンティン）から愛の告白を断られて以来、関係はギクシャクしっぱなし。記念のフライトであっても、彼とコンビを組む乗務を、平常心でこなすのには無理があった。そんな不安要素を抱えた香港便で、祁玉（チー・ユー）が乗客トラブルを起こす…。

程霄（チョン・シアオ）を陥れたのは誰か。犯人の特定が進まないことに不満な夏至（シア・ジー）とリー・ユーハンは食堂で独自に推理を始めた。関係者では、顧南亭（グー・ナンティン）に好意を寄せていた祁玉（チー・ユー）が最も怪しい――などと証拠もなしに放言していたところに現れたのは、噂の祁玉。彼女は乗客トラブルを起こした際に巻き込まれた２人に、素直に謝罪し…。

王凡（ワン・ファン）の病室を出て、会計窓口に向かった程霄（チョン・シアオ）。彼の入院費を肩代わりしようと考えた彼女だったが、そこには同様のことを考え、先に病室を出た顧南亭（グー・ナンティン）の姿が。しかし、その南亭も未払いの請求はないと窓口で断られており、２人は既に倪湛（ニー・ジャン）によって支払い済みであることを知るのだった。何かできることはないかと考えた南亭は…。

江韜（ジアン・タオ）に呼び出され、程霄（チョン・シアオ）は会食の場に顔を出した。到着するなり彼女を隣の席に座らせたのは、外部取締役の孫（スン）だ。程霄を気に入った孫は、彼女のことを褒めちぎるが、「女の子」という言葉が飛び出すと、程霄は怪訝な表情を浮かべるのだった。会食終了後、店から出てきた程霄の前に現れた顧南亭（グー・ナンティン）は、彼女の肩に触れる孫を突き飛ばし…。

入院した母に会うため地元へ帰る前に、大量の土産を買い込んだ程霄（チョン・シアオ）。物で和解に持ち込もうとする娘に父親も呆れつつ、２人でタクシーの到着を待っているところに１台の車が。中から降りてきたのは倪湛（ニー・ジャン）。彼の厚意に甘え、家まで送ってもらった２人だったが、倪湛の人柄を気に入った程霄の父からは、帰郷も面会もやめてしまおうと、まさかの提案が…。

急病人が発生し、緊急着陸の判断を迫られた機長の江韜（ジアン・タオ）は、フライトの続行を決断した。既に天候不良で一度緊急着陸をしているシンガポール路線の就航便――これ以上の遅れは許されない条件下で、病人の意識が回復したこともあり、周囲の反対を押し切って、目的地へと急ぐのだった。こうして２時間後、機体は空港に到着。安心したのも束の間、座席の乗客は息をしておらず…。

『ブラックリスト』には、同級生のアンドリュー、ハイライト、バンタット、ジンベエ、タイトルの姿が。トラフィックは学園内で暗躍する闇の組織『神の手』が姉の失踪に関わっていることを知り、『ブラックリスト』のメンバーとともに周辺人物を調査することに。『神の手』と接触した人物を尾行するなか、アンドリューは自身を差し置いてリーダーに選ばれたトラフィックの作戦に納得のいかない様子だったが…。

ハイライトは、彼女のオレンジに危険が及ばないよう『ブラックリスト』のことを話せずにいた。そんな中、学園内で起きたある事件と『神の手』との関連を調査すべく、被害者のジュートの元を訪れると、彼は建物の屋上から飛び降りようとしていた。ハイライトは彼の自殺を止め犯人捜索を約束するも、精神的に追い詰められたジュートはとんでもない行動に出る。

初恋の相手であるカップケーキと再会するタイトル。しかしカップケーキの兄であるダークは、闇の組織『神の手』から追われていた。愛する人を守るため、タイトルは『ブラックリスト』のメンバーには知らせず、ダークと2人で『神の手』とそのリーダーが集まる場所へと乗り込むのだが…。

ダークに裏切られ大怪我を負ったタイトルは、これ以上仲間に危害が及ばないよう『ブラックリスト』を抜けることに。ジンベエは情報収集のため『神の手』の一味になりすまし、彼らが運営するカジノへの潜入を試みる。しかし、そこには何故かキャロットの姿が…。

バンタットは学校内で流行りだしたあるゲームと『神の手』との関連を調べる中で、校長の姪であるライラと急接近する。一方、他のメンバーは新設された学習サポート集団『アイジーニアス』へ潜入調査をすることに。タイトルは生徒会へ入会し、生徒会長のキャンプから『ブラックリスト』のメンバーを監視するように命じられる。

『神の手』によって薬物を盛られたアンドリュー、ハイライト、ジンベエは病院に運ばれる。さらに、バンタットが何者かによって連れ去られてしまう。そんな中、ハイライトはオレンジがタイトルと親しげに話す姿を目撃。オレンジをめぐって、ハイライトとタイトルは口論になってしまう。

『神の手』のある計画を阻止するため、そしてバンテットを救出するため『ブラックリスト』のメンバーは敵のアジトに潜入する。しかし、『神の手』の一味に何故かタイトルの姿が…。

バイキングとキャンプが『神の手』のメンバーだったことで生徒会は解散となり、校内に平和が訪れたかのように思えた。しかし、ワンパデットはクリン校長が黒幕であると疑っていた。そこで『ブラックリスト』のメンバーに証拠を集めるよう指示するも、その強引なやり方にトラフィックは不信感を募らせていた。

ワンパデットとジンマニーが、クリン校長の手下によって連れ去られてしまう。一方『ブラックリスト』のメンバーは、校長が黒幕だという証拠を集めるため潜入した廃ビルで、衝撃的な現場を目撃してしまう。そしてアンドリューには、『ブラックリスト』のメンバーにも打ち明けられずにいたある秘密が…。

クリン校長が逮捕され、ジンマニー先生が新しい校長となる。事件は解決したかのように思えたが、行方不明だったトラフィックの姉のファーが突如姿を現す。彼女は何者かによって監禁されかなり憔悴していた。そこへ追い打ちをかけるように、食べ物に毒を盛られたファーは病院へ運ばれる。トラフィックは犯人を捜すべく、アンドリューとともに動き出すのだが…。

ファーを殺そうとした犯人を突き止めるべく、『ブラックリスト』のメンバーは手掛かりを探していたが、濡れ衣を着せられ学校から指名手配されてしまう。『ブラックリスト』の代わりに、『チーム・ベジ』が犯人の証拠を集めていた矢先、パッカートとメロンが捕らわれてしまう。トラフィックたちが現場に駆け付けると、そこにいたのは…。

レッドはその日午前11時に、ある場所で大惨事が起きると予言。

中国で１年半の間にＣＩＡのエージェントが４人殺される。

ＦＢＩは“シチューメイカー”確保のため、ロルカに協力を求めるが…。

レッドはエリザベスたちに犯罪のプロ、“運び屋”を逮捕させようとする。

トムは妻エリザベスに自分はスパイではないと主張するが、特別作戦本部のオフィス“郵便局”へ連れて来られる。

ワシントンＤ.Ｃ.の地下鉄で生化学兵器を使ったテロ事件が発生。被害者たちはウイルスに感染していた。

ロサンゼルス行きの貨物便が、ワシントンＤ.Ｃ.の空港を離陸直後に爆発する。

レッドは、テロから身を守るためという理由で“郵便局”に連れて行かれ拘束されるが…。