2019年。記憶消去の技術が進歩した結果、世界は崩壊寸前になっていた。

ニールとモジーは、犯人引き渡し協定がない人知れぬ島で、本名を隠して優雅に暮らしていた。

島から脱出するために落ち合う約束だった埠頭にニールは来ない。モジーとピーターは…。

ピーターは島での行動が原因で降格させられ、証拠品の保管庫へ異動になる。

インサイダー取引で捜査されたグラント・コヴィントンが事故死し…。

客を装って美術館に入ったニールの正体を見抜いたアビゲイル・キンケイドが…。

倉庫のオークションでモジーが手に入れたあるアパートの鍵。

ピーターが検察側の証人になり、連邦検事補のブライソンと共に裁判でデランシーを有罪にしようと画策していた折…。

アレックス・ハンターはニールの知人で、東欧の骨董品を専門に売買している泥棒。

ピーターのチームは、証券取引委員会の依頼でインサイダー取引を捜査し…。

ＦＢＩの各局の優秀者だけが招かれる会議の途中、事件が起こる。

デニス・フリン・ジュニアがマフィアの再建を目指していることが分かった。

ピーターとニールはプラット議員と、ニールの父をはめた汚職警官との関係を捜査する。

ニールとモジーは、エレンが残した鍵が示す場所がマンハッタンのどこにあるかを探していた。

ニールがサラに頼まれた警備をチェックしているところにカップルの強盗がやってきて…。

ニールとモジーはエレンが隠した証拠が、エンパイアステートビルの50階にあることを突き止める。

エレンが隠した証拠があるエンパイアステートビルをニールが探っていたことを知ったキャロウェイ。

イエメン共和国で凶悪組織の壊滅作戦を終えたジョナスたち。

ジョナスたちはテロリストが原子物理学者のロカ博士の誘拐を企んでいるという情報をつかみ…。

チームはコソボでプルトニウムの売買を行う仲介人ドラガンと接触。

コロンビアの麻薬組織のボスを捕獲・移送作戦を遂行することになったジョナスたち。

上層部からの命令で、ユニットの妻たちがエリオット・ギラムという男の身辺調査をすることに。

ボストンのテッド・ウィリアムズ・トンネルに爆弾を仕掛けた容疑で拘束された留学生カリード。

ジョナスの娘のベッツィーが駐留中のイラクで仲間の兵士たちと共に反抗勢力に誘拐される。

ベッツィーの身を案じるモリーはペンタゴンで心理学者のホッブズ博士と会う。

アフガニスタンの部族間の休戦を進めるため、部族同士の政略結婚を円滑に運ばせるよう指令を受けたチーム。

ウズベキスタンで進行中という細菌兵器製造計画を阻止するため、隣国アフガニスタンの基地にいたジョナスたち。

某国でクーデターが勃発。前回の作戦に同行したメッツ副次官を連れて、ジョナスたちは大統領の救出に向かう。

中国に寝返ろうとしているスパイのベリコフ奪還を指示されるジョナスたち。

ジョナスとマックが乗った偵察機がチリの山中で撃墜される。