長齢に騙され崖から落ちた無忌は、一命を取り留めたものの両脚を骨折。そこへ長齢の娘・朱九真（しゅ・きゅうしん）が飼う犬の鳴き声が聞こえてくる。武当派に邪教征伐を断られた滅絶は諦めて去っていくが、武当派の一番弟子・宋遠橋（そう・えんきょう）の息子・宋青書（そう・せいしょ）は六番弟子・殷梨亭（いん・りてい）と共に邪教征伐に加わることを決意。峨嵋派と紅梅山荘へ行き、長齢に助力を仰ぐことにする。

無忌は内功を使い峨嵋派を追い払うが、滅絶が弟子の仕返しにやってくることを恐れ、その場を去ることにする。蛛児（しゅじ）は手際よくそりを作り、そこに無忌を寝かせて出発。その夜、ふと目を覚ました無忌は蛛児が岩の上に座って何かの修練をしている姿を発見。それは「千蛛万毒手」といい、毒蜘蛛の毒を体内に取り入れる技だった。

無忌が採ってきた清心還魂草で静玄（せいげん）は一命を取り留め、滅絶は無忌に謝意を示す。翌朝、弟子の顔に蝙蝠が描かれる事件が発生。さらに翌日には柱から垂れ下がった真っ黒な布からいきなり男が姿を現し、静虚（せいきょ）を連れ去っていく。滅絶が追いかけるも、男は見事な軽功で逃走。男の名は明教の四大護教法王の１人、青翼蝠王だった。

しじゃくの手引きで峨嵋派から逃げ出した無忌と蛛児だが、たちまち滅絶が現れて行く手を阻む。３人が窮地に陥る中、遠くでこうどう派の戦いの信号が上がり、滅絶は全員を率いて助太刀に駆けつける。倚天剣を振るい次々と明教の教徒を倒す滅絶。見かねた無忌は思わず止めに入り、滅絶は明教の教徒を助けたければ自分の攻撃を３掌受けよと迫る。

光明頂にやってきた青翼蝠王と五散人（ごさんじん）は楊逍に敵意をむき出しにし、主導権を巡って激しく対立。そこへ少林派の円真（えんしん）がどこからともなく現れ、楊逍に幻陰指を食らわせる。円真は教主しか通れない抜け道を知っており、それを教主夫人から聞いたと言う。乾坤一気袋の中にいた無忌はたまらず声をかけ、説不得（せつふとく）は無忌に助けを求める。

成崑を追ってある部屋に入った無忌は、そこで不悔と再会。無忌は不悔を楊逍の元にやり、不悔の侍女・小昭（しょうしょう）の助けを得て成崑を追いかけるが、成崑によって逆に閉じ込められてしまう。出口を求めてさまよう２人はある部屋にたどり着き、そこで白骨化した陽頂天（よう・ちょうてん）夫妻の遺体を発見。さらにけんこんだいないが書かれた皮を手に入れる。

光明頂の大広間に六大正派が勢ぞろいし、まだ動けない楊逍らに代わって天鷹教の殷天正（いん・てんせい）が六派に立ち向かう。一騎打ちでは引けを取らないものの立て続けの決闘に体力を消耗した天正は、ついに床に崩れ落ちる。少林派の空智（くうち）大師が邪教殲滅の命を下し、宗維侠（そう・いきょう）が天正に襲いかかるが、そこへ秘道を抜け出した無忌が現れる。

正反両儀の技で襲いかかる崋山派と崑崙派を無忌は梅の枝１本で巧みにかわし、ついに両派とも降参。続いて滅絶が進み出て無忌に勝負を挑むが、滅絶の攻撃を無忌は軽功で軽々とかわす。滅絶の助太刀に加わった弟子たちの剣を無忌は次々と奪うが、なぜかしじゃくだけが無傷で剣を手にしているのを見た敏君が、しじゃくに無忌を刺すよう命じる。

明教の幹部たちを連れて光明頂の地下道に避難した無忌は、六派が引き揚げたと聞き、改めて教主を選び直すよう提案。しかし、楊逍らはこれを拒否し、困った無忌は教主でいる代わりに謝遜を呼び戻すことなど３つの条件を出す。話し合いを終え、光明頂を下る無忌たち。その道中、満身創痍の姿で倒れている殷梨亭を発見する。

緑柳山荘の荘主・趙敏（ちょう・びん）に誘われるまま美酒美食の歓待を受ける無忌たち。趙敏が持つ倚天剣が気になる無忌は入手先を尋ねるが、趙敏は明言を避ける。しゅう・てんが倚天剣を抜くと、中は白檀でできた木剣だった。山荘を離れた一行は、無忌を除き、毒で歩けなくなり、解毒薬を求めて山荘に戻った無忌は、趙敏ともみ合った末、地下室に落ちる。

正体不明の賊から武当派を守るため武当山へ向かった無忌。その頃、武当山では三豊が太極拳を完成させたばかりだった。そこへ打倒武当派を叫ぶ賊が襲来。賊を率いる趙敏は自らを明教教主・張無忌（ちょう・むき）と偽り、元朝への帰順を迫る。正体を隠して成り行きを見守っていた無忌が聞き捨てならない虚言に名乗り出ようとした矢先、韋一笑（い・いっしょう）が現れる。

無事に賊を撃退し、念願だった両親の墓参りを果たした無忌。今後は岱巌と梨亭の傷を治すため黒玉断続膏を手に入れること、そして遠橋を捜すことが喫緊の課題だとし、手分けして任務にあたることに。一方、不悔の介抱を受ける梨亭は離れがたくなるのを恐れて、父親と共に山を下りるべきだと不悔を突き放すが、逆に一生そばにいると言われてしまう。

趙敏から得た解毒薬と黒玉断続膏で岱巌と梨亭のけがは快方に向かい、無忌は胸をなで下ろす。その頃、江湖では明教が各派を滅ぼしているとの噂が立ち、楊逍はこうした状況を覆すため六派との連携を提案し、三豊もこれに賛同。無忌は８月５日、教徒たちを蝴蝶谷に集め、明教と各派が手を携えて元を討つと宣明することにする。

蝴蝶谷に明教の教徒たちが続々と集結し、無忌は幼い頃に義兄弟の契りを結んだ朱元璋（しゅ・げんしょう）や徐達（じょ・たつ）らと再会。彼らから行方不明の武林の士が大都の万安寺に捕らわれていることを知る。８月５日、無忌は武林各派との連携と打倒元朝を宣明。教徒たちは大義を成すべく再び各地へと散り、無忌たちも武林の士を救出するため大都へ向かう。

楊逍らと再会を喜び合った光明右使・范遥（はん・よう）は、変わり果てた容姿と今に至る経緯を説明。謎の女・趙敏は汝陽（じょよう）王の娘で、汝陽王の目的は六派と明教を倒して中原を奪うことだという。無忌らは汝陽王府に捕らわれた仲間の救出方法を探るが、十香軟筋散とその解毒薬は玄冥二老（げんめいにろう）が持っており、どちらも無色無味で判別できないという。

しじゃくと無忌の関係に釘を刺した滅絶はしじゃくを峨嵋派の掌門に正式に任命。しじゃくはかたくなに辞退するものの、滅絶の命に背けずついにこれを承諾。その頃、范遥は鹿杖客（ろくじょうかく）から解毒薬を手に入れ、塔に捕らわれている各派の士たちに飲ませようとするが、誰もが怪しんで飲もうとしない。そこへ韓姫（かんき）の行方を追う趙敏の兄・王保保（おう・ほほ）がやってくる。

塔の上層で逃げ場を失った六派の士たちに対し、無忌は内力さえ回復していれば助けられると判断し塔から飛び降りるよう呼びかける。青書はしじゃくと共に飛び降りようとするが、しじゃくは滅絶を待つと言って拒否。しじゃくは何とか滅絶を説得して塔から飛び降りるが、邪教に助けられるのをよしとしない滅絶は手を差し伸べる無忌に掌打を放つ。

大都で峨嵋派の門徒たちと遭遇した無忌は、皆の表情が硬いのが気になり尾行する。敏君はしじゃくが大都に来たのは無忌と密会するためだと非難し、掌門の印である指輪を渡すよう迫る。そこへ滅絶に戦いを挑みに来た金花婆婆が現れ、滅絶の代わりにしじゃくが手合わせするもあえなく破れ、しじゃくの気骨が気に入った婆婆はしじゃくを連れ去っていく。

謝遜は、霊蛇島に来たのは自分が屠龍刀を貸す代わりに金花婆婆が無忌を捜すと約束したからだと言い、早く無忌を捜すよう詰め寄る。無忌は今すぐにでも名乗り出たかったが、趙敏は霊蛇島の謎を解くのが先決だと制止。その後、再び島に忍び込んだ無忌は婆婆が男に謝遜から刀を奪うよう命じるところを目撃。その男は紅梅山荘で会った武烈（ぶ・れつ）だった。

ペルシャ総教の使者から逃げ出した無忌たちは、阿離の案内で大きな天坑にたどり着く。無忌は謝遜に自らの正体を明かし、10年ぶりの再会に歓喜感涙。その頃、金花婆婆は小昭を木に縛りつけ、周りに積み上げた柴木に放火。そこへ無忌と趙敏がやってきて間一髪小昭を救い出すが、ペルシャ総教の使者と争いになり、趙敏が負傷する。

無事救出された金花婆婆は謝遜を陥れようとしたことを謝罪。小昭は自分が光明頂に潜入したのはけんこんだいないを手に入れるためだったと無忌に告白し、ペルシャの宝石の指輪を見せる。みんなが一息つく中、婆婆が四大護教法王の筆頭であることに趙敏が疑問を投げかけると、謝遜は婆婆がペルシャ出身で天女とみまごう美女だったと言う。

変装を解き美しさを取り戻した金花婆婆は小昭と共にペルシャへ戻ることを決意。婆婆に呼ばれて船に行った無忌は、ペルシャ人の衣装を着た小昭と対面し、別れの挨拶を交わす。小昭を見送ったあと、趙敏は無忌の想い人が自分だと聞いた話を持ち出し無忌に真相を確かめるが、それを聞いた謝遜は趙敏と無忌は水と油だと２人に釘を刺す。

しじゃくと婚約した無忌は十香軟筋散を取り除く治療を施すが、しじゃくの内力は陰と柔が強く治療が難航。しじゃくは無忌がまだ趙敏を想っていて、その証拠に趙敏の箱を大事にしまっていると謝遜にこぼす。武当山では遠橋が、しじゃくへの想いを断ち切れず無忌を恨む青書に激怒して山籠もりを命じるが、青書はこれに背いてしじゃくを捜しに行く。

丐幇の陳友諒（ちん・ゆうりょう）は青書を仲間に引き入れるためしじゃくを捕らえて青書と引き合わせる。しかししじゃくから無忌と婚約したと聞かされて青書は逆上。しじゃくを押し倒したところへ武当派の七番弟子・莫声谷（ばく・せいこく）が現れる。その頃、朱元璋が丐幇に捕らわれたと聞いた無忌は丐幇の集まりに潜入。そこで青書がしじゃくを奪われたと自分を恨み、報復するために丐幇に帰服したことを知る。

洞穴に横たわる声谷を見た遠橋らは趙敏の仕業と決めつけ攻撃しようとするが、無忌が止めに入り、誤解だと弁明。遠橋らは妖女をかばう無忌を責めるが、そこへ青書と友諒がやってきて、２人の会話から事の真相が判明する。遠橋らを見送ったあと、無忌はしじゃくと謝遜を助けに行こうとするが、そんな無忌に趙敏は恋慕の想いをぶつける。

しじゃくを救うため無忌が丐幇の者たちと戦っていると、空から謎の女人が降臨。女人は丐幇の者たちに成崑を差し出せと命じ、丐幇の幇主・史火龍（し・かりゅう）が偽者であることを暴く。その頃、趙敏は無忌への想いを断つため寺で一心に修行に励むが、邪念は一向に消えない。そこへ保保がやってきて汝陽王が戦で深手を負い、趙敏を呼んでいると言う。

父・汝陽王に死罪を命じられた趙敏は、刀が振り下ろされる直前、范遥によって救出される。戻って刑を受け入れると言う趙敏に、范遥はある計画を提案。その頃、無忌は義軍が濠州に設立した元帥府に到着し、義軍の活躍について報告を受ける。戦を早く終わらせることこそが民のためと言う無忌に楊逍らはとっておきの策があると言う。

霊蛇島で生き返って以来、記憶を失った阿離は元帥府で久しぶりに野王と天正と再会。過去の確執を忘れ無邪気になつく阿離を野王は抱きしめる。元帥府にやってきた趙敏は陰謀が潰れたことで居場所を失い、天正は趙敏を始末しようとする。無忌は趙敏を慰めようと食事を持っていくが、そこへ２人が一緒にいると知ったしじゃくが乗り込んでくる。

無忌としじゃくの婚礼の場に現れた趙敏は、無忌に２つ目の願い事として婚礼の取りやめを要求。無忌はもちろん突っぱねるが、趙敏にある物を見せられ態度を変え、思い切った行動に出る。しじゃくは自らの決意を宣言し、朱元璋は教主が元の郡主と失踪したことで威信が地に落ちるかもしれないと不吉な予言をする。

そばにいたいと言う青書を連れて峨嵋派に戻ったしじゃくは、婚礼の件で侮辱する敏君を容赦なく痛めつけてひざまずかせ、圧倒的な力で掌門として君臨。静玄に手紙を託し丐幇との連携を画策する。一方、しじゃくの掌を受けて予想以上に体が弱っていた趙敏は、謝遜が少林寺にいることを無忌に伝え、自分を置いて救出に向かうようにと送り出す。