文化祭での、放送部ブースのライブ配信中、生徒たちの携帯電話に“ホランはいじめの加害者だった”とのメールが配信され、トークをしていたホランは倒れてしまう。翌日、ジェイたちが心配する中、ホランは堂々と登校するが、ホランに対する好奇の目と、無責任な噂が広まる。

ウンテクは、噂に翻弄されて元気のないホランに、大好きな映画を一緒に見ようと夜中の放送室へ誘い、見ているうちに、朝を迎えた。一方、ジェイは、生き方を変えようと予備校に通う手続きをし、ウンテクからホランの住所を聞き出して、ホランを慰めに訪れる。

ホランたちは学校行事の修練会に出発する。ソヒョンと同じバスに乗りたいユシンが、ウジェの席に座ってしまったため、ウジェはジェイと同じバスになる。到着すると、ソヒョンは、文化祭での挙動が怪しかったヒスから、写真を撮る口実で、携帯電話の暗証番号を聞き出す。

ジェイは忘れ物の帽子を渡すため、消灯後、ウジェに会いに行き、素直に気持ちを伝え合う。一方、ジェイを捜しに出たホランは、ウンテクに出くわし、ウンテクから、母親との確執について打ち明けられる。修練会から戻ったホランたちは、食事をしながら、恋の話に花が咲く。

“ホランのいじめによる後遺症でつらい”という匿名の投稿があり、ＳＮＳが炎上する。一方、ヒスはホランに“ウンテクに話がある”と、思わせぶりなメールを送り、ホランは慌てて放送室に駆けつける。そして、ヒスの脅しにより、ホランは、退部するとウンテクに伝える。

いじめの被害者がヒスだと思われる中、ウンテクは、ホランと分かり合えなかったことに落ち込む。そんな折、ウンテクは母親と夕食を共にする。そっけない態度のウンテクに、母親は心の内を伝える。そしてウンテクは、校内放送への投稿を通して、ホランに温かく語りかける。

ウンテクの協力により、放送室からライブ配信で、真実を語ったホラン。ジェイとユシンは、心配で、我先にホランの元に駆けつけ、ソヒョンもヒスと渡り合ったが、放送部の顧問からは、皆揃って立たされ、大目玉を食う。そして、翌日、ウンテクとホランは、初デートをする。

ウンテクとのデートの帰り道、ソヒョンが、かつて一緒に食べたトッポッキを持って、ホランの前に現れる。２年の空白を埋めるように、２人は素直な気持ちで語り合う。一方、ジェイは、ウジェとの認識のずれから、交際1000日記念を祝えず、ケンカしそうになる。

見知らぬ場所で目を覚まして逃げるジオ。それから１年が経過する。両親が失踪した真相を追い続ける刑事のハ・ヌレグルムは解体現場で発見された遺骨の身元を調べる。車にはねられたヌレグルムを助けたジオ。ジオが手から電気を発する動画が拡散され、ジオは再び追われる身となる。お礼をするためにジオが働く廃棄物処理場を訪れたヌレグルム。しかし、そこにジオの姿はなく、焼却炉からは遺体が発見されるのであった。

ビルの屋上から転落して危篤状態に陥ったジオ。キム・チョルス室長はジオを病院から連れてくるようイ・ソンに指示を出す。ソンは医者に変装して病院に潜入しジオを運び出そうとするが、途中でジオの意識が戻り、逃げられてしまう。一方、両親と一緒に消えた子供がジオだということに気付いたヌレグルム。両親に何があったのかを聞き出そうとするが、ジオは何も覚えておらず…

電車にはねられそうになったところをジオに助けられたヌレグルム。オ・ジョンファン教授は大学の同級生であるリュ・ジュングォンがジオを作ったのではないかと推測し、ヌレグルムにジュングォンを捜すよう依頼する。また、ジオとヌレグルムは過去の手がかりを求めて、ジオが幼少期を過ごした施設を訪れる。ジオが聖堂に火を放ったと証言し、ジオにおびえるシスター。しかし、ジオは何も覚えていない。

ヌレグルムはジオの体を検査するためにジオをオ教授のもとへ連れていく。だが、ジオは途中で逃げ出してしまう。ジオは自分が持っていたカードに書かれた電話番号に電話をかけてみる。その電話に出たのは友人のウォニだった。ウォニの家を訪ね、自分の過去を教えてもらうジオ。しかし、ソンに脅されていたウォニは、ジオの居場所を教えてしまう。ジオを捕まえたソンは、ジオを研究所に運ぶのだが…

ヌレグルムはジオを生かしておくべきではないとオ教授に忠告されるが、ジオを自宅に連れていく。写真を見たジオは、子供の頃にヌレグルムの家へ行ったことを思い出す。オ教授が事故で亡くなったと聞き、取り乱すヌレグルム。事故死であることを疑い捜査しようとするが、チェチーム長に止められる。そんな中、ヌレグルムはソンたちに拉致されてしまう。そのニュースを聞いたジオはヌレグルムを助けに行くのであった。

ソンたちを追いヒューマンテック研究所にたどり着いたジオ。そこでジオはジュングォンが父親だと聞く。一方、ジオをかくまっていると疑われたヌレグルムはチェチーム長から取り調べを受ける。チェチーム長はヌレグルムが両親の失踪について調査を続けていることを知る。研究所で実験台となるジオ。殺されるはずのジオを逃がすジュングォン。ヒューマンテック研究所に地下施設が隠されていることを突き止めたヌレグルムが見たものは…

ジオは地下施設で負傷したヌレグルムを病院に連れていく。翌日、ヒューマンテック研究所の研究員を殺したのは現職の警察官であるとのニュースが流れる。ヌレグルムが犯人に仕立て上げられたことを知ったジオは、ヌレグルムを連れて逃げる。地下施設の存在を明らかにしようとチェチーム長をヒューマンテック研究所に呼び出したヌレグルム。しかし、あったはずの秘密のエレベーターは跡形もなく消えていた。

ジオが過去に働いていた牧場に逃げた、ジオとヌレグルム。数か月がたちヌレグルムは自宅に戻ろうとするが、ジオに引き止められる。一方、ソンを解放することを条件にファン・ジョンアと手を結んだユナはジュングォンの研究データを盗んで逃げる。ジオの子供を妊娠して出産したヌレグルムは、ジオが不在の間に病院から連れ去られてしまう。防犯カメラを調べて、ソンたちが犯人だと知ったジオは…

両親の遺骨が事故車の中から発見され、両親を殺した犯人はジオだと知らされたヌレグルム。しかしそれを信用できず、DNA鑑定を依頼する。ヌレグルムを連れ去ったグループとチェチーム長が通じていることを知ったジオは、チェチーム長からヌレグルムの居場所を聞き出そうとする。一方、プロジェクトから外されたキム室長はプロジェクトのメンバーを皆殺しにしようと計画する。それを知ったソンはユナに逃げるよう告げる。

ジオがユナを殺したことを知ったソンは、仕返しにウォニを殺す。また、ヌレグルムの失踪にチェチーム長が関わっていることを突き止めたユチョルは、本当のことを教えてほしいとチェチーム長に詰め寄る。ユチョルを殺そうとして我に返ったチェチーム長は、ジオに教会の場所を教える。ジオは教会に閉じ込められていたヌレグルムを見つけるが、ヌレグルムはジオを受け入れない。そこでジオが家族を守るために取った行動とは…

教会から逃げようとするヌレグルムを引き止めるジオ。ジオは自分と娘がありのままの姿で生きられる世の中を作ろうと決心する。ジオを日本に売ろうとたくらんでいるキム室長はジオを捕まえるようソンに指示する。一方、ジュングォンはジオの娘が母親を認識していないことに気付く。娘が自分と同じように記憶を失っていると知ったジオは、電気ショックを与えることで細胞を強化させる治療を受けさせようとする。

自分たちと同じような人類が増えれば隠れて暮らさなくても済むと考えたジオは、ジュングォンと組み新たな人類を誕生させる計画を進める。一方、両親を殺した犯人がキム室長だと知ったヌレグルムは、ユチョルに協力してもらいキム室長の居場所を突き止める。キム室長に両親の殺害を自白させ捕まえたヌレグルムだが、キム室長に銃で撃たれてしまう。それを目の当たりにして憤慨したジオは、キム室長をビルから突き落とし…

江華島で、名士の息子チェ・チョンジュンと不思議な能力を持つ少女イ・ボンリョンは出会った。チョンジュンは17歳で科挙に合格するが、友人チェ・インギュはそんな彼を妬んでいた。ある晩、2人は他の友人らと山に繰り出す。足を滑らせ崖から落ちそうになったチョンジュンをインギュは見捨てて去るが、その彼を助けたのはボンリョンだった…。

恋に落ちたチョンジュンとボンリョン。だが、2人の仲に嫉妬するインギュの企みでボンリョンの母バンダルが捕らえられ、ボンリョンは母を助けるために能力を使ってしまう。その力に目をつけた朝廷の有力一族の息子キム・ビョンウンはボンリョンを監禁し、権力のために利用。5年後、役人となったチョンジュンはボンリョンと再会するが…。

チョンジュンの父チェ・ギョン宅に山水道人と名乗る男が現れ、チョンジュンが大出世と挫折を味わうだろうと予言する。そんな中、チョンジュンとボンリョンは王命により祝言を挙げることになるが、それは一族の財宝を奪い返すためのキム・ジャグンの策略だった。ギョンは息子に婚姻を断るように言うが、チョンジュンはボンリョンとの約束を打ち明ける。

チョンジュンとボンリョンの婚礼の儀の最中、財宝を積んだ船が爆破され大騒ぎに。ギョンは謀反の首謀者とみなされ、ビョンウンを責めたチョンジュンまでも囚われの身となるが、すべてはキム一族の仕組んだ陰謀だった。だが、機転を利かせたボンリョンによってチョンジュンは逃亡。さらに彼女は、犯人を目撃した証人になるとチョンジュンに語るが…。

父を殺され山で易学の修行をしていたチョンジュンは生まれ変わって都に出てくるが、そこで調子のいい男ヨン・パルヨンと知り合う。その頃、病に倒れた父の哲宗を見舞い、複雑な想いに捉われるボンリョン。彼女はキム一族から次の国王を見つけるように命令される。一方、チョンジュンはパルヨンに誘われ訪れた賭場で、派手に遊ぶ興宣君と出会う…。

キム一族の権力を誇示するため、水辺に米や銭を投げる儀式が行われる。銭欲しさに水に飛び込んだ赤導師が捕らわれるが、それを助けたチョンジュンの言動を民衆たちは拍手で喝采する。一方、時期国王の人材を探すボンリョンは、ミン・ジャヨンという少女にその素質があることを見抜いていた。そんな中、興宣君がチョンジュンのもとを訪れるが…。

遊郭で再会したボンリョンに冷たい言葉を吐くチョンジュン。だが、ボンリョンは彼が無事でいたことを密かに感謝するのだった。そんな中、朝廷での権力を握る趙大妃も時期国王選びに介入し、イ・ハジョンを哲宗に紹介する。一方、ボンリョンはジャヨンを捜すために遊郭に潜入することを計画し、そのためにジャグンの愛妾ナハプに接近するが…。

チョンジュンは王宮に呼ばれ、国王となる人材について占うよう命じられる。一方で彼は町で占いを続けるが、以前に占った学士のソンジンについてパルヨンから悪い噂を聞いていた。妹を遊郭で働かせて遊び呆けるソンジンはまたも科挙に落ち、やけを起こしてチョンジュンを訪ねてくる。そんな彼にチョンジュンは今後20年間凶運が続くと宣言し…。

ソンジンに首を絞められたボンリョンを助けたチョンジュン。2人は過去のわだかまりを解き、少し歩みよる。そんな中、子供たちを預かる施設がジャグンによって撤去の危機に。助けを求めるジャヨンの話を聞いたチョンジュンは、王族へ手紙を出して撤去中止を訴えるが…。そんな折、興宣君が現れ、王への取り次ぎをする見返りにあることを提案する。

チョンジュンは占いの腕試しの場でハジョンの運命を占い、一番を勝ち取る。ハジョンは賞金を与えようとするが、チョンジュンが望むのは王様との約束だけだった。後日、興宣君よりチョンジュンに書状が与えられる。ところがキム一族は国王の意向を無視し、施設は結局取り壊されることに。現場に駆けつけたチョンジュンを襲ったのは因縁の相手だった。