検察が探し出した真犯人は、ソヒョンの居場所を把握していなかった。チョルは、誘拐犯の死に際の言葉に何か感づいたようで…。ボムの推理から居場所を特定した検察だが、ソヒョンは既に冷蔵庫から姿を消していた。絶望したスヨンは意識を失ってしまう。ボムは現場に残された痕跡から、ソヒョンを連れ去った人物を明らかにする。

誘拐の疑いはチョルに向けられるが、数時間後、チョルは自らソヒョンを連れて国科捜にやって来た。事件のいきさつを知っているソヒョンは、ショックのあまり誘拐されていた間の記憶を失っていた。淡々と取り調べを受けるチョルに、違和感を感じるソル。スヨン復帰記念パーティーが何故かボムの家で催されることになり…。

マンションの一室で遺体のない殺人現場を発見する検察。殺人事件としてその部屋に住む統合失調症の男ハンスに疑いがかけられる。いつもは動かないノ次長検事が珍しく現場にやって来るが、ボムとの相性が悪いようで…。近所の住人の証言から、キルジャの遺体らしきものが発見される。一方、ハンスは息子を残したまま逃亡を図る。

遺体らしきものの正体は豚足で、遺体発見の宣言をした検察は大恥をかきカル部長は監察に呼び出される。ハンスを見つけた検察は崖まで追い込み説得を試みるが、ハンスは崖から飛び降りてしまう。一方、ボムは細かい検証を続け、キルジャの遺体の場所を突き止める。キルジャの遺体解剖が始まるが、犯人はいったい誰なのか。

検察は妹のもとへ向かったハンスを待ち伏せし、逮捕することに成功する。しかし、統合失調症患者であるハンスの取り調べは思うように進まず、プレッシャーをかけられたカル部長は名誉挽回に勤しむ。息子のドンウは父親の無実を願うが、妹は兄と縁を切りたいと怒りをあらわにする。頼みの綱であったキルジャの解剖結果は…。

カル部長は一刻も早く手柄をあげようと、証拠不十分のままハンスの身元を公表する。ボムはキルジャの診療記録を調べ、１つの手術記録に目を留める。死亡届の手続きをしたキルジャの娘は生活保護費の話に疑問を持ち…。解剖により少しずつ得た情報から、国科捜は予想外の結論を発表する。果たして事件の真相はいったい？

スヨン親子とピクニックに出かけたチョルは、ソヒョンの描いた絵を見て封印していた記憶を思い出してしまう。そんなチョルに仕事を持ってきたカル部長がボムに気をつけろと忠告するが、チョルはボムとの接触を図る。一方、モーテルでの事件を調べていたボムは、防犯カメラに映る犯人に被角血管腫らしきものがあることに気づく。

国税庁の調査官であるヨンスが毒蛇に噛まれ死亡した。しかし、ヨンスと親しくしていたジハンは他殺だと主張し、ボムに解剖を依頼する。星振グループが関わっている可能性があると聞いたボムは、ヨンスの解剖を引き受ける。一方、ソルは星振グループの不正隠しのネタとは知らず、芸能人の性的暴行事件を担当することに。

ヨンスの解剖はボムへの挑戦状とも思えるほどに困難を極めた。ボムがチョルに疑いを持っていると知ったジハンはチョルを訪ねて病院に向かうが…。性的暴行事件も、重要な証拠となる液体エクスタシーを検出できずに捜査は行き詰まる。ジハンはチョルの家宅捜索令状を申請するが、ノ次長検事とカル部長によって妨害される。

ジハンは令状がないままボムらと家宅捜査に踏み込む。生活感のない不気味な部屋には、一連の事件の詳細なスケッチが描かれた手帳と遺伝性疾患の薬があった。チョルとドクターKが同一人物だという事実にスヨンは動揺する。性的暴行事件は証拠があがらない中、ある動画の流出で逆に被害者のジヘが袋叩きにされる展開に。

徐々にドクターKの謎に迫るジハンに対し、カル部長は権力でジハンの行動をねじ伏せようとする。ボムの助言によってサリーは液体エクスタシーの検出に成功したが、何故かジヘがテレビに出演し今までの話は嘘だったと告白する。ヨンスの解剖を止められたボムは、針の先についたヨンスの組織片から真相を解明しようと試みる。

カル部長の命令を無視し一人で筏橋のチョルの生家にやってきたジハン。そんなジハンからボムに電話がかかってくるが…。ジハンが不在の中、カル部長の企みでジハンの懲戒委員会が開かれる。ジハンから東部地検は信じるなと言われたソルは、慎重に捜査を続ける。ボムはサリーに血液検査を依頼するが、その意図は…？

ボムは懲戒委員会に出向き、ヨンスの死はヘビ毒を利用した計画的な他殺だと発表する。免職を免れたジハンはチョルの母親殺しの事件帳簿を手に入れ、カル部長が関わっていると確信する。一方、証拠を掴んだ東部地検はソルの機転のきいた方法で令状を手に入れることができ、アイドル カン・ジュンソの家宅捜査に踏み切るが…。

ジハンが自分の過去を知ったと気づいたカル部長は、チョルの父親の家だと嘘を付き、ある屋敷にチョルとジハンをおびき寄せる。偽の父親を殺そうとするチョルとそれを阻止するジハン。2人はカル部長が雇った暗殺者によって撃たれ、崖から落ちてしまう。一方、ジュンソ宅の水槽の魚から液体エクスタシーが検出される。

ジュンソの逮捕により麻薬密売の捜査が広がる中、コカインの大量購入にやって来たのは、なんとマンサンだった。カル部長は後ろ盾のなくなったマンサンを脅し、模範検事賞で表彰される。ジハンは無事に発見され一命を取りとめたが、ボムにチョルの最後の言葉を託して東部地検を去る。残されたソルは監察班に誘われ…。

医師イジェは、服役中の財閥夫人ジョンヒの病状を操作して刑執行停止にすることに成功。見返りに西ソウル刑務所の医療課長に推薦してくれるよう頼む。テガングループ次男のジェファンが薬物使用で実刑判決を受け、西ソウル刑務所に収監されるという報道を見たジョンヒは、会うべき男が間もなく収監されると言ったイジェの言葉を思い出す。

イジェは３年前、ジェファンとトラブルを起こして怒りを買い、病院を追われていた。西ソウル刑務所医療課長のポストの面接に現れたイジェ。しかし現課長のミンシクはじめ刑務所の職員は、イジェが面接を予定していた人物ではないことに戸惑いを見せる。一方、ジェファンを乗せ刑務所へ向かっていた護送車が事故に遭い…。

護送車の事故は、テガン病院理事長のイラがジェファンを逃すために計画的に起こしたものだった。しかし、イラより先に現場に現れたイジェは、ジェファンをテガンの配下ではないハウン病院へ運ぶ。イジェは３年前にジェファンが引き起こした交通事故で命を落とした患者を思い起こし、重症を負ったジェファンに対し激しい怒りをぶつける。

イジェはジェファンの手術を終えると、後継者争いでジェファンと対立する異母兄ジェジュンに対し、ジェファンの刑期中には決して出所させない代わりに、次期医療課長の座が欲しいと告げる。テガン病院VIPセンター長の座を狙ってジェジュンに取り入ってきたミンシクは、ジェジュンの興味がイジェに向き始めたことに苛立ちを隠せない。

ミンシクの元に医療課長の面接に来なかったドンフンがミンシクの元に現れ、サンチュン一味に拉致されたと訴える。イジェとサンチュンらの共謀に気づいたミンシクは、糖尿病のサンチュンにインスリンを過量投与して苦しめ、イジェとの関係を暴こうとする。一方、サンチュンにハウン病院の出資者名簿を盗ませていたイジェは、名簿を盾にミンシクを脅す。

ミンシクは、出資者名簿により不正が暴かれることを恐れ、イジェに取引を持ち掛ける。ところが、ジェファンをイジェに委ねることと、自分が管理してきた刑務所のVIP名簿を引き渡すことを約束しておきながら、イラと会ってジェファンの刑執行停止を条件にVIPセンター長の座を要求。さらに、決定的な証拠を入手しイジェを陥れようとするが…。

刑務所収監中に失踪した弟を捜すソグムは、イジェから事実を明らかにしたければ協力しろと言われるが、イジェのやり方が受け入れられず断る。かつてイジェが医業停止になったのは、イジェがサインした虚偽診断書が原因と知ったイラは、イジェの狙いがその黒幕だったミンシクだと推測。イジェに協力すればジェファンを刑務所から出せると考え、ミンシクを陥れることに。

イジェはハウン病院の出資者名簿を監察局に提出するといってミンシクを脅し、医療課で優位に立つ。しかし、実際にはイジェの手元に名簿がないと気づいたミンシクは、サンチュンに危害を加え、名簿を取り戻す。一方、ソグムは刑務所で弟ビッと同室だった受刑者に会い、ビッが当時イジェに薬を打たれて意識を失ったと聞き衝撃を受ける。

サンチュンの寝返りにより刑務所内で襲われるイジェ。サンチュンはイジェを襲えば刑務所から出すとミンシクにそそのかされていたのだ。イジェはとっさに、サンチュン自身がけがを負えば、すぐに刑執行停止になるはずだと提案し説き伏せる。余命わずかな娘に会うため刑務所を出たいサンチュンは、イジェに自分の腹を刺すよう頼み…。

イジェは新たに収監されてきたJH鉄鋼会長の息子ソグに目を付け、病気を理由にソグの勾留を執行停止にさせることで会長と繋がりを持とうと計画。ソグの体調をコントロールし始める。そんななか、ミンシクはひそかにイジェとジョンヒの関係を調べ上げて検察に提供。チョン検事は、イジェがジョンヒとソグの案件の両方に関わっていることに気づく。

イジェはソグの勾留執行停止を申請。テガン病院でソグの病状の検査が行われる。その頃、チョン検事はジョンヒを訪ねイジェとの関係を問いただしていた。ジョンヒはイジェに連絡し計画中止を促すが、イジェは自信を見せる。そんななかソグが脳のMRI検査中にショック症状を起こし検査は中断。しかし、最終的にはイジェの診断通りの結果が出る。

ソグのショック症状を思い返していたソグムは、全てがイジェの計画だったと気づく。自分を利用し、犯罪者を自由にする手助けをしたと抗議するソグムに対し、イジェは復讐のためなら自分の手も汚すと言い放つ。しかしミンシクの差し金によりソグムがソグの再検査を願い出たことで、イジェの計画は頓挫。ソグムは逆上したソグに刺され…。

イジェは西ソウル刑務所に収監されていた３年前を思い出す。そこで出会ったビッは常に何かに怯えていた。ある日ミンシクに薬を投与され体に異常をきたしたビッは、意識を失う直前に自分を追い詰めている人物の名をイジェに告げたのだった。一方、ミンシクはジェジュンに対し、イジェがイラと手を組んだと吹き込んで、イジェと手を切るよう策動する。

イジェが虚偽診断をしたという証拠を準備し、ジェジュンからVIPセンター長の確約を取り付けたミンシクは、妻と祝杯を交わして悦に入っていた。しかしその頃、イジェはヘスとサンチュン、ジョンヒを集め、ミンシクが刑務所内の医薬品を違法搬出して転売し利益を得たうえに、受刑者たちには偽薬が渡されていた事実を暴こうと計画していた。

イジェの策略通りにミンシクの不正が明かされ、ミンシクは検察に連行される。ソグムはイジェを信じると決意し、協力を申し出た。イジェはさっそくソグムの手を借り、刑務所の特別棟にいるVIPたちの把握を進めることに。ジェジュンはイジェとイラの繋がりに探りを入れるが、イジェはあくまでもジェジュンのサイドについている態度を示す。