『魔銃録』という人気小説の作者が銃殺される事件が発生。凶器は、数か月前、収賄疑惑を掛けられた代議士襲撃事件で使われた古い銃と思われたが、問題の銃はすでに警察が押収し、厳重に保管されていたため、ネットでは「魔銃が現れた」と騒がれていた。

麗音（篠原ゆき子）が銃撃された事件の首謀者でありながら、罪をまぬがれたIT長者の加西周明 （石丸幹二） 。背景には、衣笠副総監（杉本哲太）の“ツルの一声”や、さらに上からの“政治的圧力”があったと思われるが、うやむやのまま実行犯である朱音静 （日南響子） だけが逮捕されていた。

白バイ警官・出雲麗音（篠原ゆき子）が銃撃された事件への関与を疑われていた男の所持品から拳銃が見つかり、被疑者死亡のまま送検されることになった。

加西 （石丸幹二） が殺し屋に狙われているという情報をめぐり、内閣情報調査室の柾庸子（遠山景織子）から協力を持ち掛けられた右京（水谷豊）と亘（反町隆史）。内調でも“加西不逮捕”の件を調査していたというが、右京はさらに上の権力者から、指示があったのではないかと疑う。いっぽう、加西の気まぐれで殺されかけた麗音（篠原ゆき子）は、鑓鞍 （柄本明） が衣笠副総監（杉本哲太）に加西の警護を要請した件も含めて、美彌子（仲間由紀恵）に不満をぶつけていた。

詐欺などの経済事件を扱う捜査二課の係長・尾崎が、遺体で発見された。同僚の刑事いわく、尾崎が追っていた詐欺グループの仕業に違いないという。

右京と亘は、小手鞠から、後輩の芸者・叶笑（高梨臨）を『怨憎会苦（おんぞうえく）』から救ってほしいと頼まれる。

右京と亘は、収賄疑惑が持たれた衆議院議員の白河達也が、自宅にゴミをまかれた“嫌がらせ”の捜査を押しつけられる。

マンションの敷地内で電子部品メーカーに勤める派遣社員の男性が死亡する事件が発生。通報者は、出張風俗店のドライバーで、たまたまマンションに店の女性を送り届けたという松野と名乗る男性。

2年前に起きたアポ電強盗殺人の被疑者が、空き家の床下から白骨遺体で発見された。

右京（水谷豊）と亘（反町隆史）は、レストランの前で揉めている男女を見掛け、間に入る。

歩道橋で女性が転落死する事件が発生。目撃者の主婦・智子の証言により、被害者の知人の男が重要参考人として浮上する。

半年前の春。官房長官の鶴田翁助（相島一之）は、加西周明（石丸幹二）暗殺事件を主導しながら、愛人である柾庸子（遠山景織子）の“自白”によって罪を逃れた。そんな中、鶴田が師と仰ぐ元官房長官の朱雀武比古（本田博太郎）が、3年前に仮出所していたことを知った特命係の杉下右京（水谷豊）と冠城亘（反町隆史）は、裏に鶴田の思惑があったのではと探りを入れる。すると、拘置所に収容されている庸子の接見が突然、禁止となった。

右京（水谷豊）と亘（反町隆史）は、角田（山西惇）からの頼みで、張り込みを手伝うことに。捜査対象は、仮想通貨の儲け話を持ち掛けるロマンス詐欺のグループ。だまし取った金の保管場所とみられる家具店を見張ることになった右京と亘は、怪しまれずに張り込むため、目の前の喫茶店に目をつける。2人は、オーナーの真鍋（酒井敏也）に事情を話し、店番をする代わりに、捜査への協力を持ち掛ける。

年末、峯秋の誘いで高級レストランを訪れた右京（水谷豊）は、与党政調会長の袴田（片岡孝太郎）と経済界の重鎮が、会合を開いているところを見掛ける。個室のテーブルには、3人の席が用意されていたので、もう1人、参加者がいると思われた。同じ夜、落としたスマホを探していた少年が、大人同士が言い争う姿を目撃。それに気づいた男に、落としたスマホを持ち去られてしまう。

元刑事の安岡（小宮孝泰）が、自宅で撲殺されているのが発見された。捜査一課は、刑事時代に逆恨みされた可能性も視野に捜査を始める。しかし、右京（水谷豊）と亘（反町隆史）は、安岡が埋蔵金探しの動画をサイトに投稿していたことに注目。事件との繋がりを疑う。手掛かりを求めて発掘現場の赤城山を訪れた右京は、安岡の宝探し仲間である新井（山本龍二）と接触。作業を手伝うという名目で周辺を探り始める。

ある日、伊丹（川原和久）のもとに、所轄時代に世話になった黒瀬という先輩刑事が訪ねてくる。現役時代、似顔絵捜査官だった黒瀬は、現在ボランティアで『冥婚絵』を描いているという。冥婚とは、未婚のまま亡くなった人の遺族が、弔いのため仮想の結婚式をあげる風習のこと。

右京（水谷豊）は、小手鞠（森口瑤子）の誘いで、氷室聖矢（渡部豪太）というフラワーアーティストの展覧会を見学する。氷室は、婚約者の女性と仲睦まじい姿を見せていたが、その後、女性が氷室のオフィスで殺されているのが発見される。捜査一課が氷室を疑ういっぽう、右京と亘（反町隆史）は、氷室と十年来の仕事仲間だという生花の卸売業者・一之瀬（冨田佳輔）から話を聞く。ところが、取り憑かれたように仕事をする氷室に、聴取を遮られてしまう。

特命係の杉下右京（水谷豊）は最近、冠城亘（反町隆史）に“春”が来た――つまり恋人ができたのではないかと勘繰っていた。このところ、そそくさと帰ることが多くなったばかりか、“野暮用”という名目でサイバーセキュリティ対策本部・青木年男（浅利陽介）との約束を2度もすっぽかしていたのだ…。同じ頃、8年前に鑓鞍兵衛（柄本明）を襲撃した京匡平（本宮泰風）という男が出所し、再び鑓鞍を狙っているという情報が浮上。日下部（榎木孝明）や美彌子（仲間由紀恵）が状況の把握に乗り出す。”準備を進めていた。

右京（水谷豊）と亘（反町隆史）が、自室で死んでいる中郷都々子（織田梨沙）を発見した。一見、自殺に見えるが、玄関は施錠されておらず、部屋が冷房で極端に冷やされているという、不可解な点もあった。それでも捜査一課は、都々子の死を、自殺として処理。納得いかない右京と亘は、捜査を続行しようとするが、亘が罪をなすりつけられた“鍵泥棒”の一件が尾を引く。

京匡平（本宮泰風）が投稿した、虚実を混ぜ込んだ告発動画によって、王隠堂家を監視していた伊丹（川原和久）たち捜査一課の行動が問題に。さらに、片山雛子（木村佳乃）と議席争っている鑓鞍兵衛（柄本明）も打撃必至の状況となる。いっぽう、怪文書により“パパ活”の疑惑を掛けられた亘（反町隆史）は、何か事情があると踏んだ右京（水谷豊）の追及で観念し、騒動の収拾に動き出す。

右京（水谷豊）と亘（反町隆史）は、青木（浅利陽介）をともなって、加西周明（石丸幹二）が生前、準備していた仮想現実の世界に足を踏み入れる。そこに、官房長官・鶴田翁助（相島一之）の“弱点”が隠されていると踏んだ右京たちは、加西のアバターに案内されるまま歩を進めるが…。いっぽう、元内閣情報官の栗橋（陰山泰）は、柾庸子（遠山景織子）の一件をめぐって捜査一課から厳しい追及を受けていたが、関与が疑われる鶴田をかばってか、完全黙秘を貫いていた。

陣川（原田龍二）は、高校時代からの友人で、現在はゲームクリエイターとして活躍している鴫野大輔（黒田大輔）から結婚式のスピーチを依頼され、大張り切り。しかし、内容が今ひとつのため、鴫野が長年世話になっているというスピーチライターの宮森由佳（瀬戸カトリーヌ）を紹介される。興味を持った右京が、陣川に同行し、由佳から話を聞いていると、陣川の携帯に鴫野から連絡が。

角田（山西惇）は、水木（伊藤洋三郎）という顔見知りの元刑事が、落ち込んでいる姿を見掛ける。水木は、2か月前から行方不明になっている大学生の娘を探すため、警察官でありながらネットで情報提供を呼び掛け、問題になった人物。しかも、寄せられた情報は冷やかしばかりで、本人は騒動の責任を取って辞職していた。そんな中、警備員の男が、施錠されたアパートの自室で首を吊って死んでいるのが発見される。

福山光一郎（菅原大吉）というベストセラー作家が、一人暮らしの自宅で刺殺された。警察は、もろもろの状況から強盗殺人の線で捜査を開始。いっぽう右京（水谷豊）は、現場から新作の最終回の原稿が消えていることに疑問を抱く。その小説は、少女殺害事件の捜査にあたる老刑事が、正体不明の犯人を執念で追い詰めていくストーリーらしいのだが…。

右京（水谷豊）と亘（反町隆史）は、小学生の女の子が若い男に、「どこに隠したの！ 早く返してよ！」と詰め寄っているところに居合わせる。見かねて割って入ったところ、2人は親権を失った父親と、娘であることが判明。事情を尋ねようとするが、女の子は理由も語らず、走り去ってしまう。翌日、川で行方不明になっていた男の子が、意識不明の重体で発見されたというニュースが流れる。

大学構内の地中から白骨死体が発見された。死後50年近くたっている時効事件のため、右京（水谷豊）と亘（反町隆史）が捜査を押しつけられる。DNA鑑定の結果、白骨は1970年代に学生運動をしていた岡田という過激派の幹部であると判明。当時の仲間によると、岡田はカリスマ指導者で、人心を操る天才だったという。そんな中、梶原（ベンガル）という物流大手社長の遺体が発見される。

右京（水谷豊）と亘（反町隆史）は、20年前に都内スーパーで起きた刺殺事件の押収品を返却するため、被害者の妻を訪ねる。犯人はまだ捕まっておらず、被害者の妻は最近までチラシを配って情報を集めていたというが、そのさなか、「自分は被害者の生まれ変わりだ」と主張する、見知らぬ若い男が現れたという。

春野翔太朗（佐藤勝利）は、恋人の三森アリサ（福本莉子）の両親に挨拶をするため、彼女と共に車で実家へ向かっていた。だがその最中に事故を起こしてしまう。とある病院で目を覚ました翔太朗はアリサがいないことに気づくが、担当医らは何故か言葉を濁して二人を会わせようとしない。やがて翔太朗は、この病院が異様な雰囲気を纏っていることに気づく。さらにアリサの病棟に忍び込んだ翔太朗に、とある出来事が降りかかる。

春野翔太朗（佐藤勝利）のベッド下から、同室の滝中良一（橋本淳）の遺体が発見される。ところが下半身はなく手には翔太朗のスマホが…。刑事の工藤（池田鉄洋）は、一緒に病室を抜け出した翔太朗の犯行を疑うが、もともと滝中の提案でアリサ（福本莉子）の病室へ行き、アリサを探している間にいなくなったと主張。その後何者かに頭を殴られ気を失ったと訴える。工藤はそのサイコパスな犯人像から、近頃起きている残虐な連続殺人事件との関連も視野に入れ…。そんな聴取の最中、滝中の下半身が発見されたとの報が入る！

下塚半太（大水洋介）の遺体が首のない状態で病院のトイレで発見される。やがて頭部は院内のゴミ捨て場で見つかるが、これで６人部屋の患者が２日で２人も殺されたことに…。松井時雄（木村了）は「次は４人の誰かが殺される」と怯えている。春野翔太朗（佐藤勝利）がまたも殺人事件に巻き込まれたことは、アリサ（福本莉子）の耳にも入っていた。心配な表情を浮かべるその顔には、今なお痛々しい包帯が…。