炎幇を維持するには多くの能量符が必要だった。丹薬を売って稼ぎたいショウ薫児（しょう・くんじ）たちは、店を持つ師兄を懐柔し、売り場の半分を貸してもらうことに。他と比べ安価で質の高いショウ炎（しょう・えん）自作の高位聚気散は評判を呼んで大もうけとなり、一同は大喜び。だが、それをよく思わない者たちがいた。韓閑（かん・かん）率いる薬幇である。商売を邪魔してきたうえ、薬幇の傘下に入ることも拒む炎幇に怒り心頭の韓閑は…。

薬幇に勝利を収めたショウ炎（しょう・えん）は、韓閑（かん・かん）のもとを訪れた。闘気を増幅させるべく聚気散を過剰に摂取した韓閑の体を案じてのことである。手当を申し出るショウ炎。それには応じたものの、彼のことが気に入らない韓閑は、和解案に賛同しなかったばかりか、今後、薬幇は炎幇の者に交替で勝負を挑むと宣言するのだった。新入生ばかりの炎幇に勝ち目はない。仲間を傷つけられるのは耐えられないと、ショウ炎は思い悩むが…。

ショウ炎（しょう・えん）が白山（はく・さん）に挑戦することに、炎幇の多くの者が反対の意を示した。それでも引き下がる気は毛頭ないショウ炎は、自分が負けても炎幇に累が及ばぬよう、幇主としてではなく一個人として挑むことを皆に告げるのだった。一度決めたら考えを曲げない性格を誰よりも知っているショウ薫児（しょう・くんじ）は、ショウ炎の意思を尊重しつつも、危険な焚天錬気塔で命を削らんばかりに鍛錬を続ける彼を心配し…。

ついに焚天錬気塔の最下層に到達したショウ炎（しょう・えん）。米騰山（べい・とうさん）は、鍛錬の成果を称える一方で、有名な異火である骨霊冷火を手に入れたことに対し、分不相応な持ち物は災いを招くと忠告するのだった。そんななか、迦南学院では今年、課外活動として全学年総出での狩りを行うことに。場所は魔獣山脈――闘気大陸で最も豊かな宝を有する場所でありながら、“魔獣の王国”と呼ばれる危険な地であり…。

不死虫の体内から出てきた箱の中にいた１人の女。山麓にある薬舗の娘のようだが、強い闘気を持つ彼女に、ショウ薫児（しょう・くんじ）は不信感を抱く。そのことを秘かにショウ炎（しょう・えん）に報告したが、時すでに遅し。林修崖（りん・しゅうがい）らは倒され、薫児自身も人質に取られてしまう。女の正体は、雲嵐宗宗主の直弟子・雲韻（うん・いん）だったのだ。彼女は、薫児を解放する代わりに自分の手助けをするよう、ショウ炎に取り引きを持ちかけ…。

清朝雍正帝（ようせい）の治政下、第四皇・子弘暦（こうれき）は自身の妻を選ぶ「福晋選び」に幼なじみの青桜（せいおう）を招請する。福晋選びの当日、母である熹貴妃（ききひ）の期待に反して、弘暦は青桜を正室である嫡福晋に選び、その証しの品の如意を授ける。同じ頃、雍正帝は第三皇子・弘時（こうじ）の二心を疑い皇籍を剥奪、続いてその母である皇后・烏拉那拉（ルビ：ウラナラ）氏にも生涯禁足の刑を言い渡す。更に雍正帝は皇后の姪にあたる青桜との婚姻を考え直すよう弘暦に強く迫るのだった。

青桜が側福晋として弘暦の王府に輿入れしてから6年の歳月が過ぎた頃、かねてより病気がちだった雍正帝が崩御する。これにより弘暦が帝位を継ぐと、雍正帝の唯一の皇后だった烏拉那拉氏に、皇帝の嫡母としての尊号を与えるべきだという声が朝廷から上がる。この話を耳にした弘暦の母・ニオフル氏は憤慨し、あからさまに青桜に八つ当たりをする。そして烏拉那拉氏が二度と再起できぬよう、青桜に究極の選択を迫るのだった。

先帝皇后・烏拉那拉氏を排除しようとする皇太后・ニオフル氏は、景仁（けいじん）宮に幽閉されている彼女に密かに毒を渡していた。は烏拉那拉氏は一族の将来を青桜に託し、毒をあおって死んでいく。叔母の死を目の当たりにした青桜だが、弘暦にその死因を問い詰められても皇太后の関与はおくびにも出さず、あくまでも先帝崩御を悲しんだあまりの急死だと言い張るのみだった。新帝の即位式が済み、皇太后が慈寧（じねい）宮へ移る準備が進められるが…。

青桜は乾隆帝（けんりゅう）が皇太后を慈寧宮へ移さずにいることを知る。そんな中、乾隆帝から青桜のもとへ如意結びと2人の思い出の芝居「牆頭馬上（しょうとうばじょう）」の楽譜が届けられる。一計を案じた青桜は、禁足の身でありながら乾隆帝を訪ね、皇太后に孝を尽くすよう説得する。その甲斐あって、慈寧宮へ移ることになった皇太后は青桜の禁足を解く。更に自らの名を捨てて生まれ変わりたいと言う青桜に、皇太后は「如懿（にょい）」という名を与えるのだった。

西洋の男性が1人の妻しか娶れないという話を宮廷画家の郎世寧（ろうせいねい）から聞いた如懿。乾隆帝に一夫一妻は理想的なことだと話し、怒りを買ってしまう。これにより乾隆帝は延禧（えんき）宮から足が遠のくが、結局は自らしたためた絵や書を如懿に贈り、仲直りをする。一方、富察（ルビ：フチャ）皇后は後宮に莫大な経費がかかっているとし、贅沢はやめて倹約するよう妃嬪たちに申し渡す。そんなある日、乾隆帝は琵琶の奏者である白蕊姫（はくずいき）という美しい女子に目をつけ…。

如懿の侍女・アジャクは、如懿だけが皇帝直筆の扁額（へんがく）を賜ったことを内務府（ないむ）で自慢げに言いふらす。その話は富察皇后や慧貴妃（けいきひ）の耳にも入り、嫉妬にかられた慧貴妃は、自分も直筆の扁額を手に入れようと乾隆帝に直談判に行く。如懿だけを特別扱いするなと、扁額をねだられた乾隆帝は、后妃たちそれぞれに書を下賜（かし）する。そんなある晩、執務を終えた乾隆帝は夜伽（よとぎ）の相手を後宮の后妃から選ばず、琵琶奏者の白蕊姫を呼べと王欽（おうきん）に伝えるのだった。

冷え性の慧貴妃に炭を横取りされて寒さに震える海常在（ルビ：ハイじょうざい）のために、如懿はひそかに炭を届ける。その様子を目撃して腹を立てる慧貴妃に、嘉貴人（かきじん）は海常在を陥れる策を献じる。ある雪の夜、慧貴妃は海常在が上位の妃にだけ使用を認められているコウラ炭を盗んだと濡れ衣を着せ、処罰しようとする。如懿は慌てて駆けつけるが、侍女の偽証により海常在は窮地に立たされてしまう。そこへ騒ぎを聞きつけた乾隆帝と皇后が現れる。

慧貴妃に無礼を働いた罰として頬をたたかれた白蕊姫は、頬に侍医院から処方された薬を塗っていた。ところが頬の腫れは引くどころか、逆に傷ができてしまう。乾隆帝が侍医を呼び調べさせたところ、肌に有毒な瑠璃茉莉（るりまつり）が混入されていることが判明する。白蕊姫は如懿が嫉妬から毒を盛ったに違いないと言い張るが、海常在は如懿の仕業であるはずがないと主張。如懿が帯びている香り袋には瑠璃茉莉は入っていないと言うのだった。

如懿が寵愛を得たことで、内務府から贈り物が続々と延禧宮に運び込まれる。乾隆帝からも緑梅の鉢が届き、如懿は喜びながらも侍女たちに自慢を慎むよう釘を刺す。一方、毒入りの薬で顔に傷を作ったマイトウオウだが、実はその背後には後宮の実権を握りたい皇太后の思惑があった。皇太后は新年の挨拶の席で、即位後初の皇子を早く産むよう后妃たちに期待をかける。子宝に恵まれない慧貴妃は、母親を亡くした第一皇子を引き取ることを思いつく。

自身の誕辰祝いの席上で如懿は乾隆帝に、彼の生母・李金桂（りきんけい）の追贈と妃陵への改葬を願い出る。だが生母が一介の女官であるという出生の秘密を隠しておきたい乾隆帝は、これをはぐらかす。それでも食い下がる如懿に対して乾隆帝は、その思いを理解するどころか、激しい怒りをぶつけて席を立ち、海常在の部屋でその夜を過ごす。皇帝の寵愛を失ったと見なされ、内務府からの手当が滞った如懿は、厳しい暮らしを強いられるのだった。

ケツホウ殿でろくに世話をされていなかった第一皇子のエイコウは、乾隆帝の希望もあり、如懿の養子として延禧宮に住むこととなる。皇后は如懿が乾隆帝の長子を手に入れ、寵愛を取り戻したことに脅威を感じ、エイコウの乳母だった女官を潜り込ませようとする。だが如懿は乳母を厳罰に処し、皇宮から追放してしまう。一方、嘉貴人は如懿に対する皇后の不安をあおったうえで、養心（ようしん）殿の王欽を取り込むため、侍女の蓮心（れんしん）を嫁がせてはどうかと提案する。

入内してまだ半年のマイジョウザイは早々に乾隆帝の子を身ごもる。皇后のご機嫌伺いに集まった妃嬪たちの前で、得意げに懐妊の報告をし、身ごもらない妃嬪たちに皮肉まで言い放つ。一方、皇后は蓮心と王欽の結婚を正式に発表する。蓮心は皇后の意向に逆らうこともできず、泣く泣く年の離れた太監のもとへ嫁ぐことに。だが婚礼の夜、２人の新居らしき所から女性の叫び声が聞こえてきたため、後宮ではさまざまな臆測が飛び交うのだった。

指名手配されたユン・ジェンはひょんなことから18年前に出会った幼い少女のことを思い出す。それがメイシャオだと気づいた彼は危険を冒して彼女に会いに行こうとするが、ユエバイたちに捕まり休眠させられることに。そこで彼らに頼みこんでメイシャオにお別れの電話をした彼は、彼女だけにわかるSOSのサインを伝えて…。

メイシャオから話を聞いたジンジーとリンチャオはユエバイの元へ。そして、1週間で事件の真犯人を見つけることを約束してユン・ジェンを連れ帰る。その後、2人はリー刑事にこれまで隠していたことも正直に打ち明け、一緒に真犯人を追い始める。一方、ユン・ジェンは命の恩人であるメイシャオにすっかりメロメロになって…。

リンチャオから協力依頼のメールを受け取るが、ユエバイに連絡を禁じられているバイ・ルーはどうしたらいいか悩み中。一方、ジンジーはメイシャオに妖怪との恋をアドバイス。本当の愛に気づかせるためユン・ジェンにはわざと冷たくするようにと言う。その頃、リンチャオはフィアンセから夫に昇格したいと考えていたが…。

リンチャオはジンジーがイケメンモデルといちゃつくのを見て、仕事とはわかっていても嫉妬心がバクハツ！　メイシャオに冷たくされて混乱するユン・ジェンと一緒に浴びるほど酒を飲む。そんな中、バイ・ルーの協力のおかげで捜査は進展するが、ホン・シーグアンの元秘書は「犯人の名はシュエ・リンチャオ」と録音を残していて…。

ユエバイと約束した期限が迫り、逃亡を覚悟したユン・ジェン。彼はメイシャオにプロポーズするためドンドンの協力を得て指輪を買いに行き、その帰りに路上でお腹の大きいバイ・ルーを目撃する。それを聞いたリンチャオとジンジーは自分たちの子供が生きているとわかって大喜び。急いでユエバイとバイ・ルーを追いかけるが…。

ユエバイと国外に逃げようとしてイーハンに誘拐されたバイ・ルー。地下室に軟禁された彼女は彼が連続殺人事件の犯人であることを知る。実はイーハンが妖怪に突然変異したのには悲しい過去があった。清の時代、イーハンは医師を目指していたドンファンという名の青年だった。だが、親子で仕えていた富豪のドラ息子に逆恨みされ…。

バイ・ルーを人質にしたイーハンにリンチャオを捕まえて差し出すように脅迫されたユエバイ。彼はリンチャオの代わりにユン・ジェンをこっそり呼び出して2人だけで会う。一方、ユン・ジェンが姿を消したことに慌てるリンチャオとジンジーは、ユエバイから送られてきた位置情報を頼りに冷凍トラックを追うが、途中で見失い…。

送られてきたユン・ジェンの遺言ビデオを見たメイシャオは泣き崩れ、ジンジーたちも悲しみに暮れる。一方その頃、脱獄させたリー教授に骨髄移植手術をさせたイーハンは拒絶反応に苦しんでいた。また、イーハンを騙してバイ・ルーを取り戻したユエバイは、リンチャオとジンジーに子供を返すつもりはなく再び海外逃亡を図り…。

ーハンからバイ・ルーを連れてこないと彼女は死ぬと聞かされたリンチャオ。バイ・ルーの行方を追った彼はユエバイと対決するが、勝負に負けて帰宅。ひどく落ちこんだリンチャオを見たジンジーは彼を慰めようと必死になる。そんな時、ジンジーのパパがガンになったとカミングアウト！　でも、その様子がなんだかヘンで…。

良心の呵責に悩み子供を返したいと望むバイ・ルーを見て改心したユエバイは、ジンジーとリンチャオに彼女を託す。そこで、リンチャオは体調を崩したバイ・ルーをイーハンに預けるが、イーハンは彼女を連れて逃亡してしまう。やがて、バイ・ルーがイーハンと初めて出会った、今は廃墟となっている病院で目を覚ますと…。

一連の事件が解決して3年。無事に生まれたリンチャオとジンジーの息子チャンアンは、普通の子供より速くすくすくと成長していた。だが、ジンジーはいまだに何かと理由をつけては結婚を引き延ばし、来月予定の挙式も映画の撮影を優先すると言いだしリンチャオを困らせる。そんな中、チャンアンが行方不明になる騒ぎが起きて…!?

母親失格ではないかと悩むジンジーはお腹の子供に名前を付けたいとリンチャオに相談。2人はシュエ・チャンアンと命名すると、一緒に子育て講座を受講する。一方、ホン・シーグアンの元秘書の行方を追うリー刑事は捜査中に不思議な夢を見る。そんな中、ジンジーが倒れて昏睡。これまでになく体が弱ってしまった彼女は…。

生死の境をさまよったジンジーが目覚め、ホッとしたリンチャオ。そんな彼にS組織はジンジーと子供を助けるためバイ・ルーのお腹に子供を移植する手術を提案する。だが、この手術の成功率は未知数。それでも受ける覚悟を決めたジンジーに、リンチャオは手術を終えたら普通のカップルのようにデートがしたいと言って…。