時は、4年前。サラはマイケルの母親殺害の容疑でFBI捜査官に連行されてしまう。

サラの命が危険に晒されていることを知ったマイケルは、彼女を助け出そうと計画を立てるが…。

復讐のためにアメリカに戻ってきたマイケル。彼を待っていたのは特別捜査官セルフだった。

サラは生きていた！ マイケルたちは組織壊滅のカギとなる“スキュラ”の解読に挑むことになる。

6枚のカードから構成されるスキュラ。マイケルたちは暗号を解読し番人全員の密会を突き止める。

番人はトルコ領事の妻だった。マイケルたちは彼女が出席すると聞き、追悼式典に潜入するが…。

次なる番人は財務省の役人。マイケルたちは金庫に入っているスキュラを奪取する作戦を立てる。

マホーンが警官を殴って逮捕された。マイケルは彼の救出を諦め、スキュラ捜索続行を提案するが？

ティーバッグの策略にまんまとハマったマイケル。スキュラのありかを探すよう脅迫されるが…。

マイケルたちの動きを察知した“将軍”と呼ばれる人物とは？ スキュラを巡って緊急事態が発生！

邪魔な巨大水道管をどう排除すればいい？ マイケルは制御盤に細工して断水状態にするが…。

地雷を踏んで身動きが取れなくなったスクレ。マホーンは制御装置を解除することはできるか!?

スキュラの保管庫にたどり着いたマイケル。しかし彼らの侵入を知った将軍が、地下へ急行する！

将軍をまんまとおびき寄せたマイケル。最後のカードを脅し取って、ついにスキャラが姿を現すが!?

裏切り者のセルフにスキャラが奪われた！ さらにミリアム殺しの罪までなすりつけられてしまう。

最後のチップを奪おうと攻撃をしかけてくるセルフ。さらにマイケルが組織に連れ去られてしまう！

マイケルを救うために、将軍に協力することを決めたリンカーン。そしてマイケルの手術が始まる。

マイケルの母は生きていた!? 母の対面と引き換えに、組織の一員になるよう誘われたマイケルは？

スキュラを奪ったのは母クリスティーナだった。リンカーンは皆の反対を押し切り、母に会いに行く。

弟からは理解を得られず、母からは殺されかける。追い詰められたリンカーンたちが行動に出る！

クリスティーナを拉致して別宅で尋問するマイケル。しかし息子より母のほうが一枚上手だった…。

クリスティーナにしてやられたことに激怒する将軍。マイケルは母からスキュラ奪還を強いられる。

兄と恋人。クリスティーナと将軍から最愛の2人の命を天秤にかけられたマイケルが取った行動は!?

スキュラは果たして誰の手に!? マイケルたちの逃走と戦いの日々が、ついにフィナーレを迎える！

見知らぬ部屋で目を覚ましたマイケル。そこに謎の男が現れて、マイケルに取引を持ちかける。

マイケルと同様に組織から解雇された元スパイのジェシー。彼はマイケルに直接助けを求めてくる。

ジェシーが新たな仲間として加入。彼は解雇予告を受ける前に、ある銃器密輸人を追っていた。

「コブラ」の正体は？ フィオナとジェシーはコブラらしき男の遺体確認のためハバナへ向かう。

「コブラ」を殺したケンドラが残した旧式のテープとは？ マイケルは彼女にある取引を持ちかける。

ケンドラの口の固さに手を焼くマイケル。一方で骨董品をめぐる泥棒事件にも関わることになる。