榊マリコ（沢口靖子）は京都府警本部長・佐伯志信（西田健）の依頼で、今、ネットで“幽霊屋敷”と話題をよんでいる廃屋を調べることになった。噂のせいで不法侵入が止まず、警察にも苦情が相次いでいることから、“心霊現象など存在しない”と科学で証明してほしいというのだ。深夜、涌田亜美（山本ひかる）、加瀬淳平（加藤諒）とともに幽霊屋敷に乗り込んだマリコは、心霊現象を次々と科学で解明。

大手商社が手がけるサツマイモの貯蔵倉庫で若手社員・星野昴（中尾聡）の刺殺体が見つかり、榊マリコ（沢口靖子）は臨場する。その商社では焼き芋用のサツマイモを扱う新規事業を立ち上げており、被害者が所属していた“焼き芋事業部”では、農家から仕入れたサツマイモを倉庫で寝かせて熟成させ、食品工場に送る業務を担っていた。

工業機械メーカー社員・山川郁夫（内野謙太）の遺体が神社の石段下で見つかり、榊マリコ（沢口靖子）ら科捜研メンバーは臨場する。山川は石段の上で何者かに凶器で頭部を殴られ、よろめいて転落したようだった。ALSライトで血痕をたどっていたマリコは、現場に残された被害者の自転車に、ライトを当てると浮かび上がるインクで謎のマークがつけられていることに気づく。このマークは何を意味するものなのか!?

身元不明の20代女性が、意識不明の状態で倒れているのが発見された。傷の状態から、事件性があると見たマリコ（沢口靖子）たち科捜研は鑑定に乗り出す。彼女が着用していたブルゾンには“ペロブスカイト太陽電池”が付けられており、そのブルゾンは2年前、“ソリスラボ”という太陽電池開発ベンチャー企業が開いたイベント“ソーラーフェス”のために作られたものだとわかる。マリコたちはすぐにソリスラボを訪ねるが、CEOの花澤樹（前川泰之）は多忙で取り付く島もない。

金属加工工場の社長・向井浩（浅田祐二）の遺体が石段の下で見つかった。打撲痕から転落事故のようにも見えたが、手のひらがまったく汚れておらず、マリコ（沢口靖子）は不審を抱く。規制線の外に出たとき、野次馬の中から「榊師匠！」とマリコを呼ぶ声が…！　声の主は、解剖医・風丘早月（若村麻由美）の娘・亜矢（染野有来）で、マリコを“師匠”として慕う彼女は医大を卒業し現在、近くの病院で研修医として勤務しているという。

精密機械メーカー研究員・保岡一隆（田村健太郎）が撲殺されているのが見つかり、榊マリコ（沢口靖子）たち科捜研メンバーは臨場する。凶器の石にはなぜか微量のニッケル合金が付着していたほか、保岡の胃の中には未消化のクッキーが残っていた…。付近の防犯カメラを確認した結果、驚きの事実が浮上。事件直前、京都府警捜査三課の篠宮小菊（松下由樹）が保岡に接触していたことがわかったのだ…！

雑居ビルの前で、転落死と思われる男性の遺体が見つかり、榊マリコ（沢口靖子）ら科捜研メンバーは臨場する。ビル屋上には彼の靴が残されていたが、その靴には彼自身の血痕が付着しており、自殺を装って殺害された可能性が濃厚となる。まもなく遺体の身元は、傷害致死の前科を持つ木本吉春だと判明。木本には11年前、兵庫県内で些細なトラブルを起こし、相手男性を殴って死亡させた過去があったのだ。

新年早々、人通りのない寂しい公園で、後頭部を強打され絶命した舞子姿の女性の遺体が発見される。臨場した榊マリコ（沢口靖子）ら科捜研メンバーは、被害者が身に着けている帯に二次元コードが印刷されているのに気づく。コードを読み取ったところ、「デジタル舞子」というサイトにつながったから驚く。「デジタル舞子」は、アプリで手軽にオーダーできる、カジュアルなお座敷遊び風サービスらしく、被害者の身元はそのデジタル舞子のひとり、本条奈々（三澤紗千香）と判明する。

とある百貨店の商品企画部オフィスで、側頭部を殴打され絶命した女性の遺体が発見される。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は被害者の右手から、握られていた繊維片と、なにかベトベトとする謎の付着物を採取。早速、鑑定を始めるのだった。一方で、第一発見者である企画部のスタッフに聞き込み捜査をする土門薫刑事（内藤剛志）。

とあるキャンプ場で、頭部に傷を負い絶命している男性の遺体が発見される。被害者は、ソロキャンプ（＝ソロキャン）を楽しんでいた南郷朋親で、誰かに突き飛ばされ、後頭部を木に強打したことが死因らしい。また、被害者のそばにアウトドア用のコーヒーミルのハンドル部分が落ちており、ここから血液反応が…。被害者のものだろうか？その時、木陰から遺体を検視する榊マリコ（沢口靖子）たちを見つめる、フードを目深にかぶった“魔法使い”のような出で立ちの人影が。

榊マリコ、宇佐見裕也、涌田亜美は山中からの任務の帰り道、ぬかるみに車のタイヤを取られ、立ち往生してしまう。

肉を熟成させるための熟成庫で両腕を吊るされた男性銀行員の遺体が発見された。マリコの見立てで生きている間に吊るされたことがわかるが、なぜか抵抗を示す外傷が見当たらない。

インテリアコーディネイターの茂手木浪子の他殺体が自室で発見された。現場には浪子が部屋で飼っていた愛犬が残されており、犯行の一部始終を見ていたと思われた…。

警察無線や防犯カメラ、Nシステムなどに技術を提供している結城テクノロジーの名誉顧問・結城節子の他殺体が自宅のベッドで発見された。

著名な作曲家・海東柊一郎の妻・莉華子の遺体が自室で発見された。遺体発見時、莉華子はフィットネスバイクにまたがったままで、ラジオはつけっぱなし、ベッドテーブルには食べかけのバースデーケーキが残されていた。

ブログが大人気のイケメン芸人・桑原バグこと桑原博文の刺殺体が高台にある公園の展望台で見つかり、そのファンである有村葉子の遺体が展望台の崖下から発見された。

アメリカ人旅行者、ジェイソン・ミラー（B.T.）の遺体が民泊していた部屋で見つかった。現場にはお香の燃えカスが落ちており、畳には焦げ跡が出来ていた。

佐藤啓太という男性の遺体が発見された。いち早く現場に駆けつけた京南署地域課の堀口裕子は、現場保存をと的確な指示を与える。

山中の川原から身元不明の水死体が発見された。死後2日以上経過しており、頭部に傷、索状痕らしきものが認められたことから首を絞めて意識を失わせた後、川に落とした可能性もある。

政治的な影響力も大きく、政界の“影のフィクサー”とも呼ばれている柳原大造が会長を務める財団が主催するお茶会に、佐伯本部長が出席することになった。

起業アドバイザー・川村ゆずの撲殺遺体が自宅の床下収納から発見された。ゆずの遺体の横には白骨化した遺体が寄り添うように横たわっている。

人気俳優・今村草太の遺体が発見された。現場の状況から石階段から足を踏み外して転落死したらしい。草太のトートバッグから、草太がアイドルの高見メグとの熱愛デートの記事が掲載された週刊誌が見つかった。

早月のかつての同僚・弓原公彦の遺体が自室から発見された。弓原は家賃を滞納、密室状態だった部屋にはまるで生活感がない。

ファイナンス会社社長・稲葉和成の刺殺体が発見された。遺体の周辺には歩き回ったような足跡があり、マリコは遺体の足首からバラの花弁を発見する。

ブランド品買い取りチェーンの社長・新庄和子が殺害され、現金が奪われる事件が発生した。

マリコらが顔認証による指名手配犯検知システムの試験を行っている最中、手配共助係で通称“ミアタリの鬼”こと桃井貞治刑事が指名手配犯を逮捕してしまった。

京都発の有名ファッションブランド「マコトタケダ」のデザイナー武田誠の遺体が店から発見された。絞殺されたようだが、なぜか床に水がこぼれている。

マリコは、ある法医学の鑑定書を手にした芝美紀江監察官の取り調べを受ける。

気鋭の演出家・浅利慶太と美保子が初めてタッグを組んだリサイタルの幕が開いた。美保子は大きなプレッシャーを抱えながら日生劇場の舞台に立つ。

京都府警察音楽隊が毎年恒例で開催している嵐山コンサートの直前、トランペットの隊員が食中毒にかかってしまい、急遽トランペット経験者の日野が助っ人として出演する事になった。